Contemporary prognostic signatures and refined risk stratification of gliomas: An analysis of 4400 tumors
- 한울 전
- 4월 5일
- 3분 분량
Hia S. Ghosh‡, Ruchit V. Patel‡, , Eleanor Woodward, Noah F. Greenwald, Varun M. Bhave,
Eduardo A. Maury, Gregory Cello, Samantha E. Hoffman, Yvonne Li, Hersh Gupta, Gilbert Youssef , Liam F. Spurr, Jayne Vogelzang, Mehdi Touat, Frank Dubois, Andrew D. Cherniack, Xiaopeng Guo, Sherwin Tavakol, Gino Cioffi , Neal I. Lindeman, Azra H. Ligon, E. Antonio Chiocca, David A. Reardon , Patrick Y. Wen , David M. Meredith , Sandro Santagata, Jill S. Barnholtz-Sloan, Keith L. Ligon, Rameen Beroukhim, and Wenya Linda Bi
Neuro-Oncology, Volume 27, Issue 1, January 2025, Pages 195–20
Abstract
Background
With the significant shift in the classification, risk stratification, and standards of care for gliomas, we sought to understand how the overall survival of patients with these tumors is impacted by molecular features, clinical metrics, and treatment received.
Methods
We assembled a cohort of patients with histopathologically diagnosed glioma from The Cancer Genome Atlas (TCGA), Project Genomics Evidence Neoplasia Information Exchange, and Dana-Farber Cancer Institute/Brigham and Women’s Hospital. This incorporated retrospective clinical, histological, and molecular data alongside a prospective assessment of patient survival.
Results
Of 4400 gliomas were identified: 2195 glioblastomas, 1198 IDH1/2-mutant astrocytomas, 531 oligodendrogliomas, 271 other IDH1/2-wild-type gliomas, and 205 pediatric-type glioma. Molecular classification updated 27.2% of gliomas from their original histopathologic diagnosis. Examining the distribution of molecular alterations across glioma subtypes revealed mutually exclusive alterations within tumorigenic pathways. Non-TCGA patients had significantly improved overall survival compared to TCGA patients, with 26.7%, 55.6%, and 127.8% longer survival for glioblastoma, IDH1/2-mutant astrocytoma, and oligodendroglioma, respectively (all P < .01). Several prognostic features were characterized, including NF1 alteration and 21q loss in glioblastoma, and EGFR amplification and 22q loss in IDH1/2-mutant astrocytoma. Leveraging the size of this cohort, nomograms were generated to assess the probability of overall survival based on patient age, the molecular features of a tumor, and the treatment received.
Conclusions
By applying modern molecular criteria, we characterize the genomic diversity across glioma subtypes, identify clinically applicable prognostic features, and provide a contemporary update on patient survival to serve as a reference for ongoing investigations.
Key Points
Molecular criteria shifted >25% of gliomas in their final histopathologic classification.
Contemporary glioma cohorts show increased survival compared to TCGA.
Molecular features identify aggressive glioma subtypes such as EGFR-amplified astrocytoma.
배경
최근 교모세포종(글리오마)의 분류, 위험 분류, 치료 표준이 크게 변화함에 따라, 우리는 이러한 종양을 가진 환자들의 전반적인 생존율이 분자적 특징, 임상 지표, 그리고 받은 치료에 따라 어떻게 달라지는지를 이해하고자 하였다.
방법
우리는 The Cancer Genome Atlas (TCGA), Project GENIE(Genomics Evidence Neoplasia Information Exchange), 그리고 Dana-Farber 암센터/브리검 여성병원에서 조직학적으로 진단된 글리오마 환자들의 코호트를 구축하였다. 이 코호트는 후향적인 임상, 조직학, 분자 데이터를 포함하며, 환자 생존에 대한 전향적 평가도 수행되었다.
결과
총 4,400건의 글리오마가 확인되었으며, 이 중 2,195건은 교모세포종, 1,198건은 IDH1/2 돌연변이 아스트로사이토마, 531건은 희소돌기교세포종, 271건은 기타 IDH1/2-야생형 글리오마, 205건은 소아형 글리오마였다. 분자 분류는 기존의 조직병리학적 진단 중 27.2%를 재분류하였다. 글리오마 아형에 따른 분자 변화의 분포를 분석한 결과, 종양 발생 경로 내에서 상호 배타적인 유전자 변이가 나타났다. TCGA 이외의 환자들은 TCGA 환자들보다 유의미하게 향상된 생존율을 보였으며, 교모세포종, IDH1/2 돌연변이 아스트로사이토마, 희소돌기교세포종에서 각각 26.7%, 55.6%, 127.8% 더 긴 생존기간을 나타냈다(모두 P < .01). 예후에 영향을 미치는 여러 요인들이 확인되었으며, 예를 들어 교모세포종에서는 NF1 변이와 21번 염색체의 손실, IDH1/2 돌연변이 아스트로사이토마에서는 EGFR 증폭과 22번 염색체의 손실 등이 있었다. 본 연구의 대규모 코호트를 활용해, 환자 나이, 종양의 분자 특징, 치료 내용에 기반하여 전반적인 생존 가능성을 예측할 수 있는 노모그램(nomogram)을 개발하였다.
결론
현대의 분자 기준을 적용함으로써, 우리는 글리오마 아형 전반에 걸친 유전적 다양성을 특징화하고, 임상적으로 적용 가능한 예후 인자를 규명했으며, 환자 생존에 대한 최신 정보를 제공하여 향후 연구의 기준점이 될 수 있도록 하였다.
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